Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms