Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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