Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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