Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP3K1Q13233 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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