Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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