Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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IFT88Q13099 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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IFT88Q13099 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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IFT88Q13099 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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