Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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