Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms