Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms