Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms