Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms