Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms