Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms