Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPCQ03188 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms