Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms