Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms