Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSF1Q00613 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSF1Q00613 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSF1Q00613 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSF1Q00613 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms