Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB1P82279 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRB1P82279 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB1P82279 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB1P82279 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms