Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAE1P78406 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms