Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRA2BP62995 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms