Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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