Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXW4P57775 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms