Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PITPNBP48739 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PITPNBP48739 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PITPNBP48739 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PITPNBP48739 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PITPNBP48739 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITPNBP48739 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PITPNBP48739 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PITPNBP48739 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PITPNBP48739 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PITPNBP48739 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PITPNBP48739 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PITPNBP48739 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PITPNBP48739 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITPNBP48739 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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