Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC1A2P43004 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms