Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms