Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms