Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRM2P31350 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RRM2P31350 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RRM2P31350 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms