Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms