Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms