Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms