Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRZ1P23471 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms