Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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