Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALB2P22676 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB2P22676 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms