Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A1P19634 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms