Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms