Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL4P13236 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4P13236 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL4P13236 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms