Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms