Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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