Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB1P08034 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms