Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms