Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms