Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLSTN1O94985 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms