Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms