Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22BO75396 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms