Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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