Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN1O60240 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN1O60240 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN1O60240 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN1O60240 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms