Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms