Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FRS3O43559 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRS3O43559 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms