Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD6O43541 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms