Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNMO15061 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNMO15061 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms